Ép bản thân tạo thêm liên kết giữa các ghi chú buộc ta phải nghĩ rộng ra: còn khái niệm nào khác liên quan đến điều mình đang nghĩ? Nó tạo sức ép để cân nhắc kỹ cách các ý tưởng gắn với nhau (xem Muốn hiểu thì phải bỏ côngGhi chú thường xanh nên hướng khái niệm). Nó cũng giúp ta nội hóa ý tưởng sâu hơn nhờ Mã hóa tinh chế.

Tìm đúng liên kết đòi hỏi đọc lại các ghi chú cũ, nên đây cũng là cơ chế tự nhiên để ôn lại ghi chú theo từng khoảng thời gian (Duy trì ghi chú thường xanh tương tự lặp lại ngắt quãng). Việc này có thể dẫn tới những phát hiện bất ngờ (Ghi chú nên làm bạn ngạc nhiên).

Ghi lại các kết nối cũng là cách lưu lại lối tư duy đã dẫn ta tới kết luận, hữu ích cho chính ta (hoặc đồng nghiệp) về sau. Càng làm được nhiều càng tốt, nên Ưu tiên các liên kết chi tiết. Ngược lại, Thẻ là cấu trúc liên kết kém hiệu quả.

Khi lướt qua ghi chú, các kết nối mở ra nhiều lối đi xuyên qua không gian ý tưởng. Ta hay bị cám dỗ điều hướng theo phân cấp, nhưng liên kết thì cắt ngang lĩnh vực và chủ đề. Ưu tiên bản thể học liên kết hơn phân loại phân cấp

Luhmann thậm chí lập luận rằng…

So với cấu trúc này, cái cung cấp các khả năng kết nối có thể được hiện thực hóa, tầm quan trọng của những gì thực sự được ghi chú là thứ yếu.

(In comparison with this structure, which offers possibilities of connection that can be actualized, the importance of what has actually been noted is secondary.)

Không nhất thiết phải liên kết tới ghi chú đã có sẵn: Liên kết ngược có thể được dùng để định nghĩa ngầm các nút trong hệ thống quản lý tri thức. Phải dừng lại viết một ghi chú mới mỗi lần cần thì cảm giác rất gượng. Liên kết tới một bản nháp thì thoải mái hơn nhiều. (xem thêm Ghi chú thường xanh cho phép tiến độ gia tăng trơn tru khi viết (viết gia tăng)).

Ngoài giá trị lâu dài của các liên kết đã ghi lại, chúng còn giúp dẫn dắt sự chú ý khi viết nháp: Van xả cho tư duy phi tuyến tính có thể hỗ trợ đầu ra tuyến tính tốt hơn.