Khi xây dựng một cơ sở tri thức cá nhân được kết nối với nhau (ví dụ: Ghi chú thường xanh nên liên kết dày đặc), liệu có quan trọng khi phải tạo mọi liên kết bằng tay không? Các công cụ như DEVONthink dùng học máy để đề xuất các ghi chú “liên quan”. Trên web, lịch sử duyệt của một người (thậm chí có thể được đặt trong ngữ cảnh dòng thời gian của một tab) có thể gợi ý một số quan hệ giữa các nội dung. Hoặc: liệu ta có thể chỉ dùng tìm kiếm khi muốn điều hướng quanh một tập hợp ý tưởng không?

Các công cụ như vậy có thể hữu ích để hỗ trợ quá trình liên kết, và có thể là nơi thứ hai để tìm liên kết, nhưng ta không nên dựa vào chúng để làm toàn bộ công việc.

Thứ nhất: quá trình suy nghĩ về quan hệ giữa các mục là một phần của cách bạn có thể Tự mình suy nghĩ. Nó buộc bạn tương tác sâu hơn với tài liệu mới.

Thứ hai: bạn muốn các liên kết của mình có tín hiệu cao, để không phải cố đánh giá một danh sách liên kết lộn xộn. Muốn đánh giá nhanh một danh sách như vậy mà không điều hướng giữa các mục, bạn phải nhớ tất cả các mục đó chứa gì. Các liên kết được chọn lọc chặt chẽ sẽ có tín hiệu cao hơn.

Thứ ba: thuật ngữ của bạn sẽ phát triển theo thời gian, nên các liên kết dựa trên văn bản sẽ không còn hữu ích lâu dài.